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All' interno del C.N.S. sono collocati moduli espositivi :

• comprendenti una  pregevole collezione ornitologica di tutte le specie europee
• dedicati ai mammiferi, ai rettili,  agli anfibi, ai pesci, agli insetti ed altri invertebrati
• dedicati ai minerali
• dedicati alla geologia e alla paleontologia della Repubblica di San Marino